Уроженец ст. Роговской. В 1980 году был призван в ряды Вооруженных Сил СССР. Через год попал в Афганистан. Там установил более 100 противопехотных мин, обезвредил более пятидесяти. Как опытный сапер, Сергей Валентинович в августе 1981 г. был направлен для выполнения боевой задачи по установке подвижных групп мин в населенном пункте Саманган. 23 числа во время минирования он и другие саперы внезапно были атакованы бандой мятежников. Начался бой, в котором Сергей погиб.
За мужество и отвагу Щекин Сергей посмертно награжден медалью «За отвагу» и орденом Красной Звезды, медалью «Воину-интернационалисту от благодарного афганского народа», грамотой Президиума Верховного Совета СССР воину-интернационалисту.
Титулован в номинации «Боевое имя Тимашевского района».